Первый сезон посвящен первому году работы выпускников медицинского университета Джона Дориана и Кристофера Тёрка в клинике. Друзья знакомятся с другими героями — еще одним интерном Эллиот, которая становится объектом ухаживаний Дориана; старшей медицинской сестрой Карлой, которая становится подругой Тёрка; главным врачом Бобом Келсо; опытным врачом Перри Коксом, которого Дориан считает своим наставником, а также с Уборщиком.
Второй сезон рассказывает о втором годе работы Джей Ди, Тёрка и Эллиот в клинике. По ходу сезона к Дориану приезжает его брат, Дэн. Доктор Кокс возобновляет отношения со своей бывшей женой, Джордан.
Третий сезон посвящен третьему году ординатуры молодых врачей. Эллиот с подачи Уборщика кардинально меняет свой имидж, а её отношения с Джей Ди вновь рушатся. У Дориана начинается роман с Данни, сестрой Джордан. Тёрк и Карла помолвлены и готовятся к свадьбе. Доктор Кокс тяжело переживает смерть друга. Серьезным отношениям Эллиот и Шона Келли препятствует полугодовая разлука.
В четвертом сезоне Джей Ди наконец заканчивает ординатуру и становится полноправным врачом. Карла и Терк, вернувшиеся из медового месяца, сталкиваются с проблемами во взаимоотношениях. Напившись, Карла и Джей Ди целуются. Кокс и Джордан узнают, что официально все еще женаты. Эллиот продолжает сердиться на Джей Ди, разбившего её сердце. Она завязывает отношения с братом Джей Ди, а сам Дориан знакомится с доктором Молли Клок. Сама же Молли становится наставницей Эллиот.
Начало пятого сезона застает Джей Ди в гостинице. Эллиот принимает предложение о работе в другой больнице. Карла и Тёрк пытаются завести ребенка, однако Тёрк всё еще сомневается в этом решении. В клинику прибывают новые стажёры. Один из них, Кит Дудмайстер, сближается с Эллиот, что вызывает недовольство Дориана.
В шестом сезоне Джей Ди примеряется к роли отца, поскольку узнает, что его бывшая девушка, доктор Ким Бриггс, беременна. У Тёрка и Карлы рождается дочь, Иззи. Эллиот готовится к свадьбе с Китом, хотя все еще сомневается из-за своих чувств к Джей Ди. У Доктора Кокса и Джордан рождается ещё один ребёнок, и в это же время умирает Лаверн.
В седьмом сезоне Джей Ди и Эллиот вновь пытаются разобраться в своих чувствах. Сам Дориан планирует жениться на Ким Бриггс, чтобы воспитывать их общего ребенка. В город приезжает брат Джей Ди, Дэн. Боб Келсо приближается к 65-годам — предельному возрасту пребывания на должности главного врача.
В восьмом сезоне появляется новый главный врач, Тэйлор Мэддокс. Впрочем, вскоре это место занимает Доктор Кокс. Доктор Келсо все еще часто появляется в клинике, они с Коксом становятся друзьями. В клинику вновь прибывает множество интернов. Эллиот и Джей Ди в очередной раз возобновляют свои отношения. Тёрк и Карла ждут ещё одного ребёнка. Уборщик и Леди женятся. Тёрк занимает должность главы хирургии. Джей Ди готовится покинуть Клинику для того, чтобы переехать ближе к своему сыну.
События девятого сезона разворачивается спустя год после окончания восьмого сезона. Действие сериала переносится в Уинстонский медицинский университет, где преподают Перри Кокс, Кристофер Тёрк и Джей Ди, который вместе с Эллиот ждёт ребёнка. В университет приходят новые студенты, трое из которых — Люси Беннет, Дрю Саффин и Коул Аронсон — становятся главными героями сериала. Также одним из основных героев девятого сезона выступает Дениз Махоуни — одна из молодых преподавателей университета.